Seine Kammermusik besteht in erster Linie aus Flötensonaten und Triosonaten; eine Flötensonate in es-Moll ist wohl als Kirnbergers bedeutendstes Werk zu bezeichnen.
Die Einleitung in es-Moll mit den rezitativischen Einwürfen der Solovioline soll angeblich »einen alten Barden vorstellen, der im Anblick eines verfallenen Schlosses der alten, herrlichen Zeiten klagend gedenkt«.
Doch ändert es sich bald in einem harten Harmoniewechsel nach es-Moll, wenn die Stimme Die Brüder dick gesät, die Brüder dick gesät, sie liegen wie gemäht, singt.
Nach einem Akkord auf der Basis von es-Moll folgt ein „akkordisch labiles Initialgebilde, das eine Reihe von dramatisch fortschreitenden, harmonisch und kontrapunktisch verankerten Durchgangsklängen auslöst“.