La uretritis gonocócica tiene un período de incubación de pocos días (en general menos de 5) y suele ser muy sintomática, aunque en raras ocasiones puede ser poco sintomática.
Dado que la vejiga se continúa a través de la uretra hacia el exterior, ésta tambíen se puede presentar inflamada (uretritis) y participar en la sintomatología de la enfermedad.