Aufgrund der vielen Passagen in Zellkulturen ist der genaue Ursprung unbekannt, jedoch sind die humanen Pockenviren, Kuhpockenviren und Vacciniaviren Abkömmlinge eines gemeinsamen Vorfahren.
Diskutiert wird deswegen, ob in Glasflaschen eingeführter Wundschorf, der mit dem Pockenvirus kontaminiert war, absichtlich oder unabsichtlich die Aborigines infizierte.