Die Böden auf den lockeren sandigen bis tonigen Ablagerungen der Ebene sind überwiegend schwarzerdeähnlich oder braune Taigaböden, stellenweise gibt es Sumpfböden.
Mit dem Abtragen des Sumpfbodens des neuen Meeres bildete sich neben der Zuiderzee auch die Waddenzee (Wattenmeer) auf der Südseite der heutigen westfriesischen Inseln.