Der deutsche Wissenschaftsrat hatte die Einrichtungen der Zentren empfohlen: Sie sollen mit den Islamwissenschaften, den theologischen Fakultäten und anderen geisteswissenschaftlichen Fächern kooperieren.
Das neue Institut sollte nach Vorschlag des Wissenschaftsrates neben der Abteilung Kognitionswissenschaft auch eine Abteilung Erziehungswissenschaft haben, die aber nicht eingerichtet wurde.
Der Vorstand (Patronat) gilt als das wesentliche Verwaltungsorgan der Stiftung, während sich der Wissenschaftsrat um die akademischen Anliegen kümmert.
