Die Kiemen sind in der Regel einfach gebaut und büschelig oder schlauchförmig, bewegliche Tracheenkiemenplättchen wie bei den Eintagsfliegen kommen nicht vor.
Darüber hinaus befinden sich an den stets unverzweigten Parapodien oft charakteristische dorsale Kiemen, bei manchen Arten auch dorsale und ventrale Cirren.