La microscopie à deux photons a été utilisée dans de nombreux domaines, notamment la physiologie, la neurobiologie, l’embryologie et l'ingénierie tissulaire.
L'embryologie est l'étude de la croissance d'un organisme durant toute la gestation, c'est-à-dire à la fois pendant la période embryonnaire et la période fœtale.
Il fait d’importantes contributions dans les domaines de l’évolution, l’embryologie des vers, l’anatomie comparée, l’hérédité et le comportement animal.